1．胸肌、腿肌有条状、斑点状或刷状出血。但也要警惕非典型传染性法氏囊病，其病变为胸肌、腿肌没有明显的出血斑点，但法氏囊皱褶轻度水肿并有明显的针尖样出血点。
2．腺胃与肌胃连接处靠近腺胃一侧有出血点或有一条出血带。
3．病初法氏囊肿胀，浆膜表面呈现黄白色胶胨样浸润，囊壁增厚，质硬，外形变圆，呈黄白色瓷器样外观，黏膜皱褶水肿有出血点或出血斑。
4．有时囊腔内有液状无色或浅黄绿色分泌物或呈豆腐渣样干酪样物。
5．病情严重者法氏囊肿大3～5倍，外观颜色像“紫葡萄”样，法氏囊黏膜皱褶严重水肿、出血或糜烂溃疡。可见胸肌、腿肌以及腹部肌肉严重出血，腹部肌肉、腿肌可呈现大片的黑色出血区。
6．肾脏不同程度的肿胀，严重者呈花斑状，肾的横切面会流出白色的尿酸盐，严重者继发痛风。输尿管内有白色的尿酸盐，呈粗、细不一的白线状。
7．常继发非典型新城疫的病变。腺胃乳头间出血、肠道有三处淋巴滤泡隆起出血，盲肠扁桃体肿胀出血，泄殖腔有点状或条状出血。
鸡传染性法氏囊病作为一种常见病和多发鸡病，偶有非典型传染性法氏囊病变出现。